| Adobe CS4, CS6, CS5 Master Collection WIN | grafika, sazba, web | náročná editace fotografií, textů, log | ne | ne | ne | Katedra botaniky a fyziologie rostlin | Skalický Milan |
| NIS Elements Ar. 4.12 | analýza obrazu | morfologie a anatomie rostlin | ano | ano | ano | Katedra botaniky a fyziologie rostlin | Skalický Milan |
| Canoco 4.0 | interpretace a analýza environmentálních dat | statistické a odhadové analýzy | ano | ano | ano | Katedra botaniky a fyziologie rostlin | Skalický Milan |
| WinDias - obrazová analýza (USA) | fyziologie rostlin, ochrana rostlin | měření listové plochy, změny zabarvení listů | ano | ano | ano | Katedra botaniky a fyziologie rostlin | Hnilička František |
| Chromeleon | ovladani HPLC | ovládací software pro HPLC a UHPLC systemy | ne | ne | ne | Katedra chemie | Kotíková Zora |
| Vision | ovladani Spektrofotometru přes PC | software pro ovladani spektrofotometru Helios gama | ne | ne | ne | Katedra chemie | Orsák Matyáš |
| ArcGIS 10.1 | mapování, územní plánování | zpracování prostorových dat | ano | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Jakšík Ondřej |
| Saga GIS | prostorové analýzy | zpracování prostorových dat, analýza digitálního modelu reliéfu | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Penížek Vít |
| GNSS Solution 3.80.8 | mapování terénu | post-processing dat z DGPS | ano | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Jakšík Ondřej |
| Chromeleon 7 | software pro iontovou chromatografii | vyhodnocení chromatografického záznamu | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Tejnecký Václav |
| Chromeleon 6.80 | software pro iontovou chromatografii | vyhodnocení chromatografického záznamu | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Tejnecký Václav |
| Chromeleon 6.80 | software pro kapalinovou a iontovou chromatografii | vyhodnocení chromatografického záznamu | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Drábek Ondřej |
| Chromeleon 6.70 | zpracování dat z HPLC (Dionex) | kvantifikace HPLC píků | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Kočárek Martin |
| Statgraphics XVII | statistický software | statistický software | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Tejnecký Václav |
| SigmaPlot 12 | grafický a statistický software | tvorba grafů a základní statistika | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Tejnecký Václav |
| Unscrambler | spektroskopie | statistické zpracování spektrálních dat půdního materiálu | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Klement Aleš |
| GS+ Geostatistics for the Environmental Sciences 5.1.1. | geostatistická analýza | tvorba variogramů a kriging | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Borůvka Luboš |
| Surfer 7.0 | tvorba map | tvorba map | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Borůvka Luboš |
| eCognition | zpracování dat dálkového průzkumu Země | analýza obrazu, zpracování údajů DPZ | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Brodský Lukáš |
| R code | matematické výpočty a simulace | statistické a geostatistické zpracování půdních údajů, vytěžování dat, matematická simulace | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Vašát Radim |
| HYDRUS | matematické modelování | modelování transportních procesů v půdě | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Kodešová Radka |
| Statistický program UPAV | výuka, výzkum, služby | statistické analýzy | ne | ne | ne | Katedra agroekologie a biometeorologie | Kolářová Michaela |
| Statistický program CanoN | výzkum, služby | analýza obrazu | ne | ne | ne | Katedra agroekologie a biometeorologie | Hamouz Pavel |
| Webová aplikace HERBA | výuka | studium | ne | ne | ne | Katedra agroekologie a biometeorologie | Soukup Josef |
| ARM 7 | výzkum, služby | statistické analýzy | ne | ne | ne | Katedra agroekologie a biometeorologie | Kolářová Michaela |
| ARM 8 | výzkum, služby | statistické analýzy | ne | ne | ne | Katedra agroekologie a biometeorologie | Kolářová Michaela |
| ARM 9 | výzkum, služby | statistické analýzy | ne | ne | ne | Katedra agroekologie a biometeorologie | Kolářová Michaela |
| FARMWORKS | výzkum, služby | statistické analýzy | ne | ne | ne | Katedra agroekologie a biometeorologie | Hamouz Pavel |
| RESOLUTION | výuka, výzkum, služby | analýza obrazu | ne | ne | ne | Katedra agroekologie a biometeorologie | Brant Václav |
| Meteorologický software | výuka, výzkum, služby | zpracování meteorologických dat | ne | ne | ne | Katedra agroekologie a biometeorologie | Kožnarová Věra |
| Magellan | spektrofotometrie | měření a vyhodnocení fluorescence | ne | ano | ano | Katedra ochrany rostlin | Zouhar Miloslav |
| Quick photomicro 3.0 | analýza obrazu | měření a úprava objektů | ne | ano | ano | Katedra ochrany rostlin | Zouhar Miloslav |
| Nis Elements (Laboratory Imaging, Praha) | analýza digitalizovaného obrazu | | ne | ano | ano | Katedra veterinárních disciplin | Nevoral Jan |
| Nis Elements, modul CASA (Laboratory Imaging, Praha) | analýza digitalizovaného obrazu + analýza motility spermií | | ne | ano | ano | Katedra veterinárních disciplin | Šimoník Ondřej |
| SW Statgraphic | statistický SW | vyhodnocení experimentálních dat | ne | ano | ano | Katedra pícninářství a trávníkářství | Svobodová Miluše |
| SW Canoco | statistický SW | vyhodnocení experimentálních dat | ne | ano | ano | Katedra pícninářství a trávníkářství | Hakl Josef |
| SW Bluehill | fyzikální parametry rostlinného materiálu | vyhodnocovací a ovládací SW k trhacímu stroji | ne | ano | ano | Katedra pícninářství a trávníkářství | Hakl Josef |
| SW Chameleon | kapalinová chromatografie | rostlinné fenolické sloučeniny v rostliném a živožišném materiálu | ne | ano | ano | Katedra mikrobiologie, výživy a dietetiky | Havlík Jaroslav |
| SW Magellan | spektrofotometrie | absorbance, fluroscence pro stanovení antioxidační, cytotoxické a antibakteriální aktivitě | ne | ano | ano | Katedra mikrobiologie, výživy a dietetiky | Doskočil Ivo |
| SW Aplied biosystems real-time PCR | real-time PCR | exprese genu | ne | ano | ano | Katedra mikrobiologie, výživy a dietetiky | Hroncová Zuzana |
| Lookin´Body Basic | výživa člověka | vyhodnocení měření z přístroje InBody 230 | ne | ano | ano | Katedra mikrobiologie, výživy a dietetiky | Plachý Vladimír |
| Lookin´Body 3.0 | výživa člověka | vyhodnocení měření z přístroje InBody 230 | ne | ano | ano | Katedra mikrobiologie, výživy a dietetiky | Plachý Vladimír |
| Bionumerix | mikrobiologie | vyhodnocování gelů | ne | ne | ne | Katedra mikrobiologie, výživy a dietetiky | Bunešová Věra |
| Lucie | mikrobiologie | analýza obrazu | ne | ne | ne | Katedra mikrobiologie, výživy a dietetiky | Pechar Radko |
| Software k mikroskopům | mikrobiologie | Software k mikroskopům | ne | ne | ne | Katedra mikrobiologie, výživy a dietetiky | Pechar Radko |
| Noldus Observer XT | Etologie | kvantifikace chování z videosouborů | ne | ano | ano | Katedra zoologie a rybářství | Kopecký Oldřich |
| Zoner Photo studio ver. 9 | bitmapová grafika - digitální fotografie | bitmapová grafika - digitální fotografie | ne | ano | ne | Katedra zoologie a rybářství | Petrtýl Miloslav |
| Lightroom 3 | bitmapová grafika - digitální fotografie | bitmapová grafika - digitální fotografie | ne | ano | ne | Katedra zoologie a rybářství | Petrtýl Miloslav |
| Lightroom 4 | bitmapová grafika - digitální fotografie | bitmapová grafika - digitální fotografie | ne | ano | ne | Katedra zoologie a rybářství | Petrtýl Miloslav |
| NIS-Elements D | taxonomie | skládání obrazu a zvyšování hloubky ostrosti fotografie | ne | ano | ano | Katedra zoologie a rybářství | Kubík Štěpán |
| SW Clarity | plynová chromatografie | profil mastných kyselin, cholesterolu apod. | ne | ano | ano | Katedra speciální zootechniky | Čítek Jaroslav |
| SW ChromNav | kapalinová chromatografie | bílkoviny ve vejcích, aminokyselinové spektrum, androstenon, skatol, indol, oligosacharidy v mléce apod. | ne | ano | ano | Katedra speciální zootechniky | Čítek Jaroslav |
| SW LUCIE | obkreslování ALOKA, histologie | histologie tukové a svalové tkáně | ne | ano | ano | Katedra speciální zootechniky | Čítek Jaroslav |
| SW NIS | obkreslování ALOKA, histologie | histologie tukové a svalové tkáně | ne | ano | ano | Katedra speciální zootechniky | Čítek Jaroslav |
| SW Bluehill | textura - Instron | histologie tukové a svalové tkáně | ne | ano | ano | Katedra speciální zootechniky | Čítek Jaroslav |
| SW QC SPA | křapkostroj | kvalita vajec s ohledem na technologickou jakost | ne | ano | ano | Katedra speciální zootechniky | Čítek Jaroslav |
| licence AutoCAD Civil 3D | sadovnictví, stabitelství, architektura | vytváření 2D a 3D modelů projektů | ne | ne | ne | Katedra zahradní a krajinné architektury | Vacek Oldřich |
| aplikace mapová vyhledávací | mapové analýzy | sestavení mapových analýz, vyhledávání podkladových materiálů | ne | ne | ne | Katedra zahradní a krajinné architektury | Vacek Oldřich |
| software - hypertextové odkazy | vyhledávání a vytváření hypertextových odkazů | podkladové materiály pro práce | ne | ne | ne | Katedra zahradní a krajinné architektury | Vacek Oldřich |
| licence CORELDRAW | dsign | designové zpracování projektů | ne | ne | ne | Katedra zahradní a krajinné architektury | Vacek Oldřich |
| software Statgraphics | statistika | statistický balík obsahující základní a pokročilé statistické funkce | ano jako služba | ano jako služba | ano jako služba | Katedra vodních zdrojů | Báťková Kamila |
| software HYDRUS 2D-Standard+licence | modelování proudění vody, roztoků a tepla v pórézním prostředí | simulace proudění vody, roztoků a tepla v různě nasyceném pórézním prostředím, např. v půdě | ano jako služba | ano jako služba | ano jako služba | Katedra vodních zdrojů | Báťková Kamila |
| software DASY lab 9 | automatizované řízení experimentů | komplexní aplikace pro řízení "real-time" experimentů s možností grafické a numerické kontroly výstupů" | ano jako služba | ano jako služba | ano jako služba | Katedra vodních zdrojů | Báťková Kamila |
| software MODFLOW | modelování proudění podzemní vody | simulace proudění podzemní vody a transportu kontaminantů v lokálním i regionálním měřítku | ano jako služba | ano jako služba | ano jako služba | Katedra vodních zdrojů | Báťková Kamila |
| Premiere Pro CS5 WIN CZ EDU Lic+DVD | editace videa | umožňuje editaci videa a zvuku ve velmi vysokém rozlišení | ano jako služba | ano jako služba | ano jako služba | Katedra vodních zdrojů | Matula Svatopluk |