| Laboratoř morfologie a anatomie rostlin | stanovení anatomických a morfologických strukrur rostl. pletiv a orgánů | ano | ano | ano | Katedra botaniky a fyziologie rostlin | Skalický Milan |
| Laboratoř spalné kalorimetrie | stanovení spalného tepla a výhřevnosti | ano | ano | ano | Katedra botaniky a fyziologie rostlin | Hnilička František |
| Laboratoř vodního režimu rostlin | stanovení obsahu vody v rostlině a půdě | ano | ano | ano | Katedra botaniky a fyziologie rostlin | Hniličková Helena |
| Laboratoř růstu a vývoje rostlin | pěstování rostlin v řízených podmínkách | ano | ano | ano | Katedra botaniky a fyziologie rostlin | Hniličková Helena |
| Laboratoř fotosyntézy rostlin | stanovení rychlosti primárního metabolismu | ano | ano | ano | Katedra botaniky a fyziologie rostlin | Hnilička František |
| Skleník | pěstování rostlin v částečně řízených podmínkách | ano | ano | ano | Katedra botaniky a fyziologie rostlin | Hniličková Helena |
| Společná laboratoř KCH a VÚM | analýza mléka a méčných výrobků | ano | ano | ne | Katedra chemie | Hejtmánková Alena |
| laboratoř stopové analýzy | servisni analyza toxických kovů | ano | ano | ano | Katedra chemie | Miholová Dana |
| laboratoř LC-MS | analýza přírodních látek, kvantifikace | ano | ano | ano | Katedra chemie | Kotíková Zora |
| Plynová chromatografie | GC/MS analýzy | ano | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Fraňková Adéla |
| Iontová chromatografie | Stanovení kationtů a aniontů (včetně nízkomolekulárních organických kyselin) ve vodných roztocích či extraktech blízkých vodě | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Tejnecký Václav |
| Laboratoř chemické analýzy | Stanovení prvkového složená materiálů (rozklad vzorků, AAS, ICP-OES) | ano | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Drábek Ondřej |
| Laboratoř půdní fyziky | Stanovení stability půdních agregátů, retenčních křivek a tepelných vlastností půdy aj. materiálů | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Kodešová Radka |
| Laboratoř GIS | Analýza a zpracování prostorových dat, digitálního modelu reliéfu, údajů DPZ; tvorba map | ne | ano | ano | Katedra pedologie a ochrany půd | Penížek Vít |
| Diasporologická laboratoř | sledování základních biologických vlastností semen | ano | ne | ne | Katedra agroekologie a biometeorologie | Hamouzová Kateřina |
| PCR laboratoř | stanovení analýz metodou PCR | ano | ne | ne | Katedra agroekologie a biometeorologie | Hamouzová Kateřina |
| Pedologická laboratoř | zaměření na sledování vztahů rostlin | ano | ne | ne | Katedra agroekologie a biometeorologie | Brant Václav |
| Agroekologická laboratoř | analýzy vlastností půdy | ano | ne | ne | Katedra agroekologie a biometeorologie | Brant Václav |
| Laboratoř rostlinolékařské mykologie | Kultivační testy rezistence, diagnostika, poradenství | ano | ano | ano | Katedra ochrany rostlin | Evženie Prokinová |
| Laboratoř rostlinoékařské virologie | diagnostika- biologická a molekulární charakteristika, monitornig patogenů, ApMV,PDV, PNRSV, CVA, CGRMV, CNRMV, CVA, PLMVd,EMARaV, BNYVV, CVA. | ano | ano | ano | Katedra ochrany rostlin | Grimová Lenka |
| Laboratoř molekulární diagnostiky patogenů a škůdců rostlin | Diagnostika -morfologická i molekulárně biologická, fytoparazitických háďátek, hub, hmyzích škůdců. | ano | ano | ano | Katedra ochrany rostlin | Zouhar Miloslav |
| Laboratoř histologie | zpracování živočišných tkání technikou parafinových řezů a kryořezů, přehledná a speciální barvení, imunohistochemie | ne | ano | ano | Katedra veterinárních disciplin | Krejčířová Romana |
| Laboratoř digitalizace a analýza obrazu | pořízení digitálního záznamu obrazu - stativ, lupa, světelný a fluorescenční mikroskop, analýza prostřednictvím systému Nis-Elements (Laboratory Imaging, Praha) | ne | ano | ano | Katedra veterinárních disciplin | Nevoral Jan |
| Laboratoř spermatologie | hodnocení kvality ejakulátu a inseminačních dávek | ano | ano | ano | Katedra veterinárních disciplin | Šichtař Jiří |
| Laboratoř klinická biochemie | kolorimetrická, popř. imunochemická analýza krevního séra, příp. dalších tělních tekutin | ne | ano | ano | Katedra veterinárních disciplin | Hůlková Magdalena |
| Laboratoř proteomika | detekce proteinů, příp. jejich aktivity - elektroforéza, western-blot, kinázová esej | ne | ano | ano | Katedra veterinárních disciplin | Žalmanová Tereza |
| Laboratoř kultivace oocytů | studium biologie savčích oocytů | ne | ano | ano | Katedra veterinárních disciplin | Tůmová Lenka |
| Laboratoř hematologie | stanovení červeného a bílého krevního obrazu | ne | ano | ano | Katedra veterinárních disciplin | Fučíková Alena |
| Laboratoř kvalita píce | stanovení obsahu dusíku v rostlinné biomase | ano | ano | ano | Katedra pícninářství a trávníkářství | Hakl Josef |
| Laboratoř kalorimetrie | stanovení obsahu energie v rostlinné biomase | ano | ano | ano | Katedra pícninářství a trávníkářství | Fuksa Pavel |
| Laboratoř zpracování a kvalita píce | fyzikální parametry roslinného materiálu | ne | ano | ano | Katedra pícninářství a trávníkářství | Hakl Josef |
| Laboratoř zpracování biomasy | šrotování biomasy | ne | ano | ano | Katedra pícninářství a trávníkářství | Fuksa Pavel |
| Laboratoř tkánových kultůr | cytototixicita přírodní látek na buněčných tkáních, adhese probiotik na buněčný model střeva člověka | ne | ano | ano | Katedra mikrobiologie, výživy a dietetiky | Doskočil Ivo |
| Laboratoř parazitologie | parazitologická diagnostika | ne | ano | ano | Katedra zoologie a rybářství | Vadlejch Jaroslav |
| Laboratoř molekulární biologie, proteomiky a mikroskopie | molekulární analýzy, proteomika a mikroskopie | ne | ano | ne | Katedra zoologie a rybářství | Vadlejch Jaroslav |
| Chov laboratorních hlodavců | kultivace parazitů laboratorních hlodavců | ne | ano | ne | Katedra zoologie a rybářství | Čadková Zuzana |
| Experimentální místnost pro laboratorní hlodavce | metabolické experimenty s laboratorními hlodavci | ne | ano | ne | Katedra zoologie a rybářství | Čadková Zuzana |
| Laboratoř zkoušení jakosti obilovin | Rozbory - nákupní hodnocení zrna obilovin, luštěnin a olejnin; kvalitativní hodnocení šrotu obilovin a mouky, reologické hodnocení těsta, laboratorní mletí mouky, hodnocení pečiva z pekařského pokusu | ano | ano | ano | Katedra kvality zemědělských produktů | Faměra Oldřich |
| Laboratoř histologie | histologie tukové a svalové tkáně | ne | ano | ano | Katedra speciální zootechniky | Čítek Jaroslav |
| Laboratoř technologie vajec | kvalita vajec s ohledem na technologickou jakost | ne | ano | ano | Katedra speciální zootechniky | Okrouhlá Monika |
| Laboratoř hodnocení inseminačních dávek | kontrola a hodnocení ejakulátů | ano | ano | ano | Katedra speciální zootechniky | Čítek Jaroslav |
| Laboratoř plynová chromatografie | profil mastných kyselin, cholesterolu apod. | ne | ano | ano | Katedra speciální zootechniky | Okrouhlá Monika |
| Laboratoř kapalinová chromatografie | bílkoviny ve vejcích, aminokyselinové spektrum, androstenon, skatol, indol, oligosacharidy v mléce apod. | ne | ano | ano | Katedra speciální zootechniky | Okrouhlá Monika |
| Laboratoř kvalita živočišných produktů (maso, mléko, vejce) | fyzikální a chemické hodnocení kvality živočišných produktů | ne | ano | ano | Katedra speciální zootechniky | Okrouhlá Monika |
| Laboratoř genetika PSR | analýza DNA | ne | ano | ano | Katedra speciální zootechniky | Čítek Jaroslav |
| Laboratoř rostlinných explantátů a mykologie | kultivace rostlinných explantátů a mycelia jedlých a léčivých hub in vitro, | ne | ano | ano | Katedra zahradnictví | Svozilová Lenka |
| Laboratoř rostlinného materiálu I (Suchdol) | Vyhodnocování rostlinného a mykologického materiálu z polních a laboratorních experimentů | ne | ano | ne | Katedra zahradnictví | Svozilová Lenka |
| Laboratoř rostlinného materiálu II (Troja) | Vyhodnocování rostlinného a mykologického materiálu z polních a laboratorních experimentů | ano | ano | ano | Katedra zahradnictví | Svozilová Lenka |
| Laboratoř půdní fyziky | Měření základních fyzikálních vlastností , zrnitostního složení, retenčních křivek, nasycené a nenasycené hydraulické vodivosti, stanovení meze tekutosti a mezi plasticity (všechna měření se týkají půdy) | ano | ano | ano | Katedra vodních zdrojů | Miháliková Markéta |
| Laboratoř půdní fyziky-terén | Měření infiltrace a hydraulické vodivosti půdy v terénu, odběr neporušených a porušených vzorků v terénu | ano | ano | ano | Katedra vodních zdrojů | Miháliková Markéta |
| Kalibrace čidel vlhkosti půdy a potenciálu vody v půdě | Kalibrace čidel vlhkosti půdy a potenciálu vody v půdě | ano | ano | ano | Katedra vodních zdrojů | Doležal František |